Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 DTNA-226ENST00000596745 1508 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 AC087292.1-201ENST00000573371 512 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 AC083760.1-201ENST00000589621 670 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 OR6C74-201ENST00000343870 1105 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 PMS1-202ENST00000374826 948 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 LINC01745-201ENST00000430921 372 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 Z80107.1-201ENST00000436830 412 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 Z77249.1-201ENST00000444622 1175 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 AC099520.1-203ENST00000506976 464 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 TMEM68-206ENST00000519784 1009 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 AL137802.2-201ENST00000562878 1110 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 AC021517.1-203ENST00000590257 421 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 AC092192.1-201ENST00000633154 1018 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 ACMSD-201ENST00000356140 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 ACMSD-202ENST00000392928 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 C8orf22-201ENST00000303202 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 AC023590.1-204ENST00000434023 431 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 AL606517.1-201ENST00000446914 387 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 ZNF277-206ENST00000450657 1075 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 ESRRAP2-203ENST00000453309 822 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms