Protein–RNA interactions for Protein: Q01518

CAP1, Adenylyl cyclase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAP1Q01518 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAP1Q01518 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms