Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IRF9Q00978 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms