Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACTA1P68133 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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ACTA1P68133 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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ACTA1P68133 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTA1P68133 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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