Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms