Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 TRPA1-201ENST00000262209 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 MYO15B-236ENST00000633867 6323 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 SYMPK-214ENST00000599814 6537 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 LPCAT2-201ENST00000262134 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 DUOX2-201ENST00000389039 6533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HERVK_113P61574 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.7 ms