Protein–RNA interactions for Protein: P61088

UBE2N, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2NP61088 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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UBE2NP61088 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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UBE2NP61088 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
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UBE2NP61088 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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UBE2NP61088 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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UBE2NP61088 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBE2NP61088 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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