Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
MCCD1P59942 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms