Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJA9P57773 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GJA9P57773 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJA9P57773 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJA9P57773 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJA9P57773 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJA9P57773 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJA9P57773 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJA9P57773 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GJA9P57773 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJA9P57773 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJA9P57773 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJA9P57773 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJA9P57773 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJA9P57773 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJA9P57773 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJA9P57773 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJA9P57773 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJA9P57773 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJA9P57773 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJA9P57773 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJA9P57773 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJA9P57773 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJA9P57773 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJA9P57773 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJA9P57773 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJA9P57773 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJA9P57773 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJA9P57773 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJA9P57773 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJA9P57773 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJA9P57773 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJA9P57773 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJA9P57773 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJA9P57773 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJA9P57773 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJA9P57773 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJA9P57773 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJA9P57773 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GJA9P57773 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GJA9P57773 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GJA9P57773 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJA9P57773 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GJA9P57773 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJA9P57773 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJA9P57773 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJA9P57773 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJA9P57773 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJA9P57773 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJA9P57773 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJA9P57773 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJA9P57773 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJA9P57773 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJA9P57773 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJA9P57773 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GJA9P57773 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GJA9P57773 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJA9P57773 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJA9P57773 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJA9P57773 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJA9P57773 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJA9P57773 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJA9P57773 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GJA9P57773 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJA9P57773 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GJA9P57773 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJA9P57773 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJA9P57773 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJA9P57773 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJA9P57773 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJA9P57773 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GJA9P57773 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJA9P57773 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJA9P57773 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJA9P57773 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJA9P57773 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJA9P57773 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GJA9P57773 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJA9P57773 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GJA9P57773 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJA9P57773 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJA9P57773 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJA9P57773 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJA9P57773 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJA9P57773 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJA9P57773 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJA9P57773 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJA9P57773 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJA9P57773 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJA9P57773 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJA9P57773 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJA9P57773 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GJA9P57773 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJA9P57773 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJA9P57773 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJA9P57773 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJA9P57773 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJA9P57773 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJA9P57773 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJA9P57773 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms