Protein–RNA interactions for Protein: P55084

HADHB, Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHBP55084 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HADHBP55084 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HADHBP55084 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HADHBP55084 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HADHBP55084 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HADHBP55084 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HADHBP55084 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HADHBP55084 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HADHBP55084 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HADHBP55084 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HADHBP55084 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HADHBP55084 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HADHBP55084 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HADHBP55084 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HADHBP55084 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HADHBP55084 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HADHBP55084 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HADHBP55084 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HADHBP55084 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HADHBP55084 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HADHBP55084 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HADHBP55084 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HADHBP55084 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HADHBP55084 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HADHBP55084 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HADHBP55084 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HADHBP55084 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HADHBP55084 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HADHBP55084 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HADHBP55084 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HADHBP55084 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HADHBP55084 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HADHBP55084 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HADHBP55084 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HADHBP55084 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HADHBP55084 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HADHBP55084 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HADHBP55084 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HADHBP55084 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HADHBP55084 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HADHBP55084 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HADHBP55084 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HADHBP55084 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HADHBP55084 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HADHBP55084 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HADHBP55084 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HADHBP55084 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HADHBP55084 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HADHBP55084 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HADHBP55084 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HADHBP55084 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HADHBP55084 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HADHBP55084 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HADHBP55084 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HADHBP55084 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HADHBP55084 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HADHBP55084 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HADHBP55084 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HADHBP55084 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HADHBP55084 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HADHBP55084 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HADHBP55084 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HADHBP55084 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HADHBP55084 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HADHBP55084 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HADHBP55084 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HADHBP55084 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HADHBP55084 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HADHBP55084 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HADHBP55084 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HADHBP55084 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HADHBP55084 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HADHBP55084 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HADHBP55084 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HADHBP55084 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HADHBP55084 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HADHBP55084 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HADHBP55084 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HADHBP55084 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HADHBP55084 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HADHBP55084 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HADHBP55084 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HADHBP55084 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HADHBP55084 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HADHBP55084 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HADHBP55084 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HADHBP55084 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HADHBP55084 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HADHBP55084 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HADHBP55084 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HADHBP55084 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HADHBP55084 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HADHBP55084 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
HADHBP55084 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
HADHBP55084 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
HADHBP55084 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
HADHBP55084 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HADHBP55084 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HADHBP55084 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HADHBP55084 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms