Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms