Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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PGGT1BP53609 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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PGGT1BP53609 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
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PGGT1BP53609 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
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PGGT1BP53609 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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PGGT1BP53609 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PGGT1BP53609 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
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