Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNA3P52797 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms