Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms