Protein–RNA interactions for Protein: P43026

GDF5, Growth/differentiation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF5P43026 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GDF5P43026 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GDF5P43026 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GDF5P43026 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GDF5P43026 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GDF5P43026 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GDF5P43026 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GDF5P43026 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GDF5P43026 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GDF5P43026 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GDF5P43026 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GDF5P43026 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GDF5P43026 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GDF5P43026 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GDF5P43026 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GDF5P43026 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GDF5P43026 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GDF5P43026 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GDF5P43026 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GDF5P43026 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GDF5P43026 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GDF5P43026 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GDF5P43026 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GDF5P43026 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GDF5P43026 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GDF5P43026 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GDF5P43026 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GDF5P43026 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GDF5P43026 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GDF5P43026 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GDF5P43026 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GDF5P43026 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GDF5P43026 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GDF5P43026 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GDF5P43026 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GDF5P43026 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GDF5P43026 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GDF5P43026 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GDF5P43026 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GDF5P43026 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GDF5P43026 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GDF5P43026 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GDF5P43026 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GDF5P43026 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GDF5P43026 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GDF5P43026 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GDF5P43026 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GDF5P43026 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GDF5P43026 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GDF5P43026 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GDF5P43026 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GDF5P43026 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GDF5P43026 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GDF5P43026 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GDF5P43026 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GDF5P43026 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GDF5P43026 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GDF5P43026 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GDF5P43026 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GDF5P43026 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GDF5P43026 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GDF5P43026 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GDF5P43026 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GDF5P43026 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GDF5P43026 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GDF5P43026 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GDF5P43026 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GDF5P43026 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GDF5P43026 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GDF5P43026 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GDF5P43026 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GDF5P43026 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GDF5P43026 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GDF5P43026 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GDF5P43026 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GDF5P43026 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GDF5P43026 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GDF5P43026 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GDF5P43026 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GDF5P43026 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GDF5P43026 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GDF5P43026 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GDF5P43026 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GDF5P43026 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GDF5P43026 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GDF5P43026 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GDF5P43026 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GDF5P43026 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GDF5P43026 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GDF5P43026 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GDF5P43026 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
GDF5P43026 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GDF5P43026 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GDF5P43026 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GDF5P43026 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GDF5P43026 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GDF5P43026 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GDF5P43026 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GDF5P43026 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GDF5P43026 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms