Protein–RNA interactions for Protein: P42575

CASP2, Caspase-2, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP2P42575 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CASP2P42575 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CASP2P42575 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CASP2P42575 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CASP2P42575 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CASP2P42575 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CASP2P42575 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CASP2P42575 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CASP2P42575 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CASP2P42575 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CASP2P42575 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CASP2P42575 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CASP2P42575 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CASP2P42575 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CASP2P42575 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CASP2P42575 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CASP2P42575 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CASP2P42575 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CASP2P42575 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CASP2P42575 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CASP2P42575 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CASP2P42575 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP2P42575 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP2P42575 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP2P42575 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP2P42575 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP2P42575 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP2P42575 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP2P42575 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP2P42575 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP2P42575 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP2P42575 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP2P42575 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP2P42575 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP2P42575 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP2P42575 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP2P42575 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP2P42575 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP2P42575 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP2P42575 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP2P42575 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP2P42575 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP2P42575 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP2P42575 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP2P42575 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP2P42575 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP2P42575 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP2P42575 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP2P42575 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP2P42575 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP2P42575 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP2P42575 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP2P42575 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP2P42575 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP2P42575 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP2P42575 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP2P42575 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP2P42575 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP2P42575 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP2P42575 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP2P42575 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP2P42575 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP2P42575 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP2P42575 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASP2P42575 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP2P42575 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP2P42575 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP2P42575 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP2P42575 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP2P42575 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP2P42575 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP2P42575 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP2P42575 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP2P42575 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP2P42575 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP2P42575 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP2P42575 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP2P42575 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP2P42575 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP2P42575 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP2P42575 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP2P42575 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP2P42575 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP2P42575 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP2P42575 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP2P42575 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP2P42575 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP2P42575 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP2P42575 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP2P42575 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP2P42575 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASP2P42575 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP2P42575 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP2P42575 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP2P42575 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP2P42575 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP2P42575 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP2P42575 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP2P42575 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP2P42575 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms