Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTR1BP42025 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms