Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNFSF9P41273 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNFSF9P41273 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNFSF9P41273 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNFSF9P41273 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNFSF9P41273 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNFSF9P41273 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNFSF9P41273 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNFSF9P41273 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TNFSF9P41273 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFSF9P41273 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFSF9P41273 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFSF9P41273 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFSF9P41273 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFSF9P41273 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFSF9P41273 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFSF9P41273 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFSF9P41273 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFSF9P41273 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFSF9P41273 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFSF9P41273 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFSF9P41273 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFSF9P41273 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFSF9P41273 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFSF9P41273 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFSF9P41273 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFSF9P41273 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFSF9P41273 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFSF9P41273 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFSF9P41273 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFSF9P41273 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFSF9P41273 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFSF9P41273 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFSF9P41273 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFSF9P41273 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFSF9P41273 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFSF9P41273 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFSF9P41273 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFSF9P41273 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TNFSF9P41273 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFSF9P41273 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFSF9P41273 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFSF9P41273 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFSF9P41273 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFSF9P41273 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFSF9P41273 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFSF9P41273 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFSF9P41273 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFSF9P41273 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFSF9P41273 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFSF9P41273 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFSF9P41273 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFSF9P41273 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFSF9P41273 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFSF9P41273 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFSF9P41273 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFSF9P41273 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFSF9P41273 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFSF9P41273 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFSF9P41273 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFSF9P41273 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFSF9P41273 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFSF9P41273 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFSF9P41273 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFSF9P41273 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFSF9P41273 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFSF9P41273 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFSF9P41273 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFSF9P41273 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFSF9P41273 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFSF9P41273 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFSF9P41273 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFSF9P41273 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFSF9P41273 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFSF9P41273 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFSF9P41273 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFSF9P41273 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFSF9P41273 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNFSF9P41273 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TNFSF9P41273 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TNFSF9P41273 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
TNFSF9P41273 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNFSF9P41273 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNFSF9P41273 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNFSF9P41273 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNFSF9P41273 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNFSF9P41273 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNFSF9P41273 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNFSF9P41273 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNFSF9P41273 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNFSF9P41273 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNFSF9P41273 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNFSF9P41273 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNFSF9P41273 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNFSF9P41273 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNFSF9P41273 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNFSF9P41273 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNFSF9P41273 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNFSF9P41273 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNFSF9P41273 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms