Protein–RNA interactions for Protein: P40818

USP8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP8P40818 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP8P40818 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP8P40818 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP8P40818 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP8P40818 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP8P40818 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP8P40818 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP8P40818 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP8P40818 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP8P40818 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP8P40818 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
USP8P40818 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
USP8P40818 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP8P40818 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP8P40818 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
USP8P40818 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP8P40818 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
USP8P40818 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
USP8P40818 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP8P40818 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC18■□□□□ 0.47
USP8P40818 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP8P40818 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP8P40818 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP8P40818 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
USP8P40818 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
USP8P40818 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
USP8P40818 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP8P40818 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP8P40818 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC18■□□□□ 0.47
USP8P40818 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
USP8P40818 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
USP8P40818 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
USP8P40818 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC18■□□□□ 0.47
USP8P40818 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
USP8P40818 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
USP8P40818 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP8P40818 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP8P40818 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
USP8P40818 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP8P40818 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP8P40818 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP8P40818 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
USP8P40818 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP8P40818 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP8P40818 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC18■□□□□ 0.47
USP8P40818 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP8P40818 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
USP8P40818 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
USP8P40818 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP8P40818 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
USP8P40818 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP8P40818 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP8P40818 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP8P40818 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP8P40818 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP8P40818 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP8P40818 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP8P40818 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP8P40818 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP8P40818 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP8P40818 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP8P40818 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP8P40818 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP8P40818 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP8P40818 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP8P40818 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP8P40818 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP8P40818 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP8P40818 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP8P40818 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP8P40818 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP8P40818 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP8P40818 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP8P40818 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
USP8P40818 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP8P40818 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP8P40818 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP8P40818 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP8P40818 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
USP8P40818 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP8P40818 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP8P40818 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP8P40818 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP8P40818 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP8P40818 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP8P40818 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP8P40818 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP8P40818 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP8P40818 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP8P40818 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP8P40818 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP8P40818 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP8P40818 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP8P40818 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP8P40818 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP8P40818 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
USP8P40818 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP8P40818 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP8P40818 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP8P40818 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms