Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PPARGP37231 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PPARGP37231 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PPARGP37231 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PPARGP37231 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PPARGP37231 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PPARGP37231 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PPARGP37231 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PPARGP37231 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PPARGP37231 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PPARGP37231 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PPARGP37231 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PPARGP37231 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PPARGP37231 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PPARGP37231 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PPARGP37231 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PPARGP37231 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PPARGP37231 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PPARGP37231 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PPARGP37231 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PPARGP37231 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PPARGP37231 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PPARGP37231 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PPARGP37231 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PPARGP37231 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PPARGP37231 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PPARGP37231 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PPARGP37231 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PPARGP37231 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PPARGP37231 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PPARGP37231 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PPARGP37231 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PPARGP37231 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PPARGP37231 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PPARGP37231 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PPARGP37231 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PPARGP37231 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PPARGP37231 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PPARGP37231 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PPARGP37231 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PPARGP37231 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PPARGP37231 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PPARGP37231 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PPARGP37231 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PPARGP37231 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PPARGP37231 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PPARGP37231 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PPARGP37231 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PPARGP37231 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PPARGP37231 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PPARGP37231 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PPARGP37231 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PPARGP37231 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PPARGP37231 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PPARGP37231 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PPARGP37231 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PPARGP37231 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PPARGP37231 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PPARGP37231 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PPARGP37231 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PPARGP37231 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PPARGP37231 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PPARGP37231 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PPARGP37231 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PPARGP37231 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PPARGP37231 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PPARGP37231 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PPARGP37231 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PPARGP37231 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PPARGP37231 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PPARGP37231 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PPARGP37231 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PPARGP37231 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PPARGP37231 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PPARGP37231 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PPARGP37231 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PPARGP37231 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PPARGP37231 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PPARGP37231 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PPARGP37231 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PPARGP37231 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PPARGP37231 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PPARGP37231 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PPARGP37231 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PPARGP37231 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PPARGP37231 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PPARGP37231 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PPARGP37231 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PPARGP37231 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PPARGP37231 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PPARGP37231 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PPARGP37231 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PPARGP37231 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PPARGP37231 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PPARGP37231 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PPARGP37231 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PPARGP37231 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PPARGP37231 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PPARGP37231 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PPARGP37231 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms