Protein–RNA interactions for Protein: P28907

CD38, ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD38P28907 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD38P28907 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD38P28907 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD38P28907 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD38P28907 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD38P28907 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD38P28907 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD38P28907 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD38P28907 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD38P28907 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD38P28907 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD38P28907 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD38P28907 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD38P28907 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD38P28907 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD38P28907 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD38P28907 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD38P28907 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD38P28907 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD38P28907 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD38P28907 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD38P28907 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD38P28907 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CD38P28907 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD38P28907 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD38P28907 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD38P28907 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD38P28907 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD38P28907 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD38P28907 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD38P28907 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD38P28907 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD38P28907 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD38P28907 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD38P28907 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD38P28907 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD38P28907 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD38P28907 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD38P28907 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD38P28907 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD38P28907 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD38P28907 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD38P28907 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD38P28907 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD38P28907 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD38P28907 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD38P28907 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD38P28907 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD38P28907 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD38P28907 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD38P28907 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD38P28907 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD38P28907 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD38P28907 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD38P28907 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD38P28907 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD38P28907 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD38P28907 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD38P28907 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD38P28907 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD38P28907 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CD38P28907 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD38P28907 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD38P28907 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD38P28907 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD38P28907 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD38P28907 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD38P28907 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD38P28907 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD38P28907 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD38P28907 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD38P28907 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD38P28907 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD38P28907 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CD38P28907 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CD38P28907 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD38P28907 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD38P28907 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD38P28907 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD38P28907 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD38P28907 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD38P28907 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD38P28907 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD38P28907 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD38P28907 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD38P28907 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD38P28907 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD38P28907 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD38P28907 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD38P28907 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD38P28907 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD38P28907 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD38P28907 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD38P28907 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD38P28907 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD38P28907 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD38P28907 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD38P28907 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD38P28907 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD38P28907 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93 ms