Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

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Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NMBRP28336 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NMBRP28336 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NMBRP28336 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NMBRP28336 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NMBRP28336 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NMBRP28336 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NMBRP28336 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NMBRP28336 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NMBRP28336 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NMBRP28336 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NMBRP28336 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NMBRP28336 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NMBRP28336 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NMBRP28336 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NMBRP28336 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NMBRP28336 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NMBRP28336 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NMBRP28336 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NMBRP28336 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NMBRP28336 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NMBRP28336 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NMBRP28336 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NMBRP28336 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NMBRP28336 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NMBRP28336 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NMBRP28336 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NMBRP28336 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NMBRP28336 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NMBRP28336 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NMBRP28336 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NMBRP28336 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NMBRP28336 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NMBRP28336 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NMBRP28336 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NMBRP28336 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NMBRP28336 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NMBRP28336 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NMBRP28336 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NMBRP28336 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NMBRP28336 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NMBRP28336 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NMBRP28336 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NMBRP28336 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NMBRP28336 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NMBRP28336 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NMBRP28336 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NMBRP28336 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NMBRP28336 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NMBRP28336 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NMBRP28336 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NMBRP28336 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NMBRP28336 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NMBRP28336 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NMBRP28336 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NMBRP28336 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NMBRP28336 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NMBRP28336 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NMBRP28336 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NMBRP28336 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NMBRP28336 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NMBRP28336 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NMBRP28336 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NMBRP28336 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NMBRP28336 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NMBRP28336 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NMBRP28336 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NMBRP28336 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NMBRP28336 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NMBRP28336 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NMBRP28336 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NMBRP28336 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NMBRP28336 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NMBRP28336 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NMBRP28336 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NMBRP28336 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NMBRP28336 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NMBRP28336 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NMBRP28336 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NMBRP28336 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NMBRP28336 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NMBRP28336 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NMBRP28336 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NMBRP28336 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NMBRP28336 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NMBRP28336 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NMBRP28336 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NMBRP28336 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NMBRP28336 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NMBRP28336 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NMBRP28336 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NMBRP28336 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NMBRP28336 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NMBRP28336 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NMBRP28336 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NMBRP28336 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NMBRP28336 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NMBRP28336 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NMBRP28336 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NMBRP28336 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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