Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC10.62□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC10.62□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
VPREB1P12018 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms