Protein–RNA interactions for Protein: P10911

MCF2, Proto-oncogene DBL, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2P10911 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCF2P10911 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCF2P10911 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCF2P10911 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCF2P10911 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCF2P10911 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCF2P10911 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
MCF2P10911 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCF2P10911 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCF2P10911 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCF2P10911 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCF2P10911 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCF2P10911 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCF2P10911 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCF2P10911 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCF2P10911 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCF2P10911 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCF2P10911 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCF2P10911 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCF2P10911 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCF2P10911 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCF2P10911 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCF2P10911 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCF2P10911 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCF2P10911 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCF2P10911 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCF2P10911 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
MCF2P10911 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCF2P10911 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCF2P10911 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCF2P10911 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCF2P10911 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCF2P10911 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
MCF2P10911 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCF2P10911 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
MCF2P10911 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCF2P10911 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCF2P10911 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCF2P10911 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCF2P10911 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCF2P10911 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCF2P10911 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCF2P10911 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCF2P10911 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCF2P10911 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCF2P10911 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCF2P10911 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
MCF2P10911 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCF2P10911 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCF2P10911 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCF2P10911 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCF2P10911 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MCF2P10911 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MCF2P10911 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MCF2P10911 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MCF2P10911 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MCF2P10911 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MCF2P10911 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
MCF2P10911 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MCF2P10911 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MCF2P10911 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MCF2P10911 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MCF2P10911 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MCF2P10911 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MCF2P10911 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MCF2P10911 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MCF2P10911 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MCF2P10911 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MCF2P10911 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MCF2P10911 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MCF2P10911 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MCF2P10911 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MCF2P10911 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MCF2P10911 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MCF2P10911 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MCF2P10911 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MCF2P10911 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MCF2P10911 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MCF2P10911 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
MCF2P10911 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MCF2P10911 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MCF2P10911 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MCF2P10911 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MCF2P10911 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MCF2P10911 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MCF2P10911 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MCF2P10911 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MCF2P10911 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MCF2P10911 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MCF2P10911 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MCF2P10911 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MCF2P10911 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MCF2P10911 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MCF2P10911 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MCF2P10911 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MCF2P10911 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MCF2P10911 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MCF2P10911 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MCF2P10911 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MCF2P10911 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms