Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW3

SMIM10L1, Small integral membrane protein 10-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L1P0DMW3 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMIM10L1P0DMW3 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM10L1P0DMW3 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms