Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C4BP0C0L5 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C4BP0C0L5 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
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