Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGAVP06756 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGAVP06756 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGAVP06756 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGAVP06756 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGAVP06756 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGAVP06756 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGAVP06756 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGAVP06756 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGAVP06756 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGAVP06756 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGAVP06756 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGAVP06756 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGAVP06756 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGAVP06756 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGAVP06756 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGAVP06756 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGAVP06756 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGAVP06756 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGAVP06756 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGAVP06756 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGAVP06756 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGAVP06756 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGAVP06756 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGAVP06756 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGAVP06756 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGAVP06756 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGAVP06756 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGAVP06756 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGAVP06756 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGAVP06756 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGAVP06756 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGAVP06756 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGAVP06756 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGAVP06756 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGAVP06756 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGAVP06756 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGAVP06756 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGAVP06756 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGAVP06756 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGAVP06756 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGAVP06756 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGAVP06756 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGAVP06756 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGAVP06756 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGAVP06756 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGAVP06756 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGAVP06756 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGAVP06756 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGAVP06756 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGAVP06756 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGAVP06756 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGAVP06756 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGAVP06756 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGAVP06756 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGAVP06756 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGAVP06756 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGAVP06756 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms