Protein–RNA interactions for Protein: P05090

APOD, Apolipoprotein D, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APODP05090 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APODP05090 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APODP05090 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APODP05090 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APODP05090 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APODP05090 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APODP05090 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APODP05090 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APODP05090 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APODP05090 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
APODP05090 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
APODP05090 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
APODP05090 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APODP05090 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APODP05090 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APODP05090 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APODP05090 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APODP05090 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APODP05090 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APODP05090 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APODP05090 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APODP05090 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
APODP05090 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APODP05090 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APODP05090 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
APODP05090 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APODP05090 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APODP05090 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
APODP05090 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APODP05090 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
APODP05090 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APODP05090 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APODP05090 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APODP05090 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APODP05090 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APODP05090 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APODP05090 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APODP05090 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APODP05090 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APODP05090 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
APODP05090 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APODP05090 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APODP05090 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APODP05090 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APODP05090 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APODP05090 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APODP05090 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APODP05090 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APODP05090 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APODP05090 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APODP05090 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APODP05090 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APODP05090 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APODP05090 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APODP05090 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APODP05090 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APODP05090 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APODP05090 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APODP05090 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APODP05090 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APODP05090 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APODP05090 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APODP05090 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APODP05090 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APODP05090 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APODP05090 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APODP05090 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APODP05090 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APODP05090 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APODP05090 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APODP05090 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APODP05090 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APODP05090 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APODP05090 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APODP05090 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APODP05090 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APODP05090 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APODP05090 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APODP05090 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APODP05090 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APODP05090 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APODP05090 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APODP05090 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APODP05090 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APODP05090 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APODP05090 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APODP05090 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
APODP05090 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APODP05090 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APODP05090 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APODP05090 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APODP05090 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APODP05090 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APODP05090 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APODP05090 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APODP05090 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APODP05090 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APODP05090 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APODP05090 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APODP05090 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms