Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP2O75323 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms