Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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SCN2BO60939 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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SCN2BO60939 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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SCN2BO60939 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
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