Protein–RNA interactions for Protein: O43852

CALU, Calumenin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALUO43852 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CALUO43852 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CALUO43852 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CALUO43852 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CALUO43852 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CALUO43852 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CALUO43852 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CALUO43852 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CALUO43852 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CALUO43852 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CALUO43852 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CALUO43852 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CALUO43852 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CALUO43852 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CALUO43852 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CALUO43852 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CALUO43852 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CALUO43852 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CALUO43852 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CALUO43852 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CALUO43852 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CALUO43852 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CALUO43852 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CALUO43852 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CALUO43852 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CALUO43852 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CALUO43852 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CALUO43852 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CALUO43852 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CALUO43852 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CALUO43852 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CALUO43852 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CALUO43852 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CALUO43852 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CALUO43852 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CALUO43852 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CALUO43852 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CALUO43852 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CALUO43852 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CALUO43852 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CALUO43852 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CALUO43852 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CALUO43852 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CALUO43852 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CALUO43852 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CALUO43852 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CALUO43852 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CALUO43852 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CALUO43852 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CALUO43852 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CALUO43852 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CALUO43852 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CALUO43852 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CALUO43852 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CALUO43852 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CALUO43852 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CALUO43852 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CALUO43852 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CALUO43852 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CALUO43852 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CALUO43852 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CALUO43852 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CALUO43852 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CALUO43852 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CALUO43852 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CALUO43852 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CALUO43852 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CALUO43852 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CALUO43852 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CALUO43852 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CALUO43852 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CALUO43852 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CALUO43852 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CALUO43852 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CALUO43852 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CALUO43852 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CALUO43852 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CALUO43852 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CALUO43852 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CALUO43852 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CALUO43852 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CALUO43852 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CALUO43852 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CALUO43852 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CALUO43852 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CALUO43852 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CALUO43852 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CALUO43852 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CALUO43852 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CALUO43852 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CALUO43852 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CALUO43852 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CALUO43852 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CALUO43852 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CALUO43852 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CALUO43852 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CALUO43852 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CALUO43852 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CALUO43852 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CALUO43852 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms