Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
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