Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LRRTM2O43300 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms