Protein–RNA interactions for Protein: O15178

T, Brachyury protein, humanhuman

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Length 435 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TO15178 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TO15178 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TO15178 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TO15178 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TO15178 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TO15178 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TO15178 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TO15178 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TO15178 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TO15178 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TO15178 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TO15178 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TO15178 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TO15178 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TO15178 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TO15178 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TO15178 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TO15178 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TO15178 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TO15178 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TO15178 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TO15178 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TO15178 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TO15178 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TO15178 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TO15178 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TO15178 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TO15178 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TO15178 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TO15178 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TO15178 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TO15178 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TO15178 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TO15178 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TO15178 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TO15178 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TO15178 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TO15178 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TO15178 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TO15178 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TO15178 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TO15178 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TO15178 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TO15178 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TO15178 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TO15178 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TO15178 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TO15178 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TO15178 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TO15178 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TO15178 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TO15178 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TO15178 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TO15178 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TO15178 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TO15178 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TO15178 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TO15178 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TO15178 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TO15178 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TO15178 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TO15178 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TO15178 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TO15178 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TO15178 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TO15178 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TO15178 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TO15178 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TO15178 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TO15178 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TO15178 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TO15178 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TO15178 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TO15178 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TO15178 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TO15178 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TO15178 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TO15178 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TO15178 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TO15178 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TO15178 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TO15178 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TO15178 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TO15178 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TO15178 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TO15178 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TO15178 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TO15178 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TO15178 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TO15178 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TO15178 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TO15178 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TO15178 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TO15178 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TO15178 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TO15178 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TO15178 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TO15178 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TO15178 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TO15178 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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