Protein–RNA interactions for Protein: O00743

PPP6C, Serine/threonine-protein phosphatase 6 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP6CO00743 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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PPP6CO00743 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPP6CO00743 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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