Protein–RNA interactions for Protein: J3QRK9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QRK9 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
J3QRK9 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
J3QRK9 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
J3QRK9 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
J3QRK9 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
J3QRK9 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
J3QRK9 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
J3QRK9 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
J3QRK9 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
J3QRK9 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
J3QRK9 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
J3QRK9 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
J3QRK9 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
J3QRK9 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
J3QRK9 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
J3QRK9 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
J3QRK9 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
J3QRK9 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
J3QRK9 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
J3QRK9 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
J3QRK9 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
J3QRK9 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
J3QRK9 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
J3QRK9 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
J3QRK9 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
J3QRK9 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
J3QRK9 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
J3QRK9 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
J3QRK9 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
J3QRK9 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
J3QRK9 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
J3QRK9 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
J3QRK9 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
J3QRK9 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
J3QRK9 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
J3QRK9 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
J3QRK9 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
J3QRK9 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
J3QRK9 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
J3QRK9 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
J3QRK9 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
J3QRK9 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
J3QRK9 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
J3QRK9 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
J3QRK9 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
J3QRK9 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
J3QRK9 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
J3QRK9 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
J3QRK9 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
J3QRK9 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
J3QRK9 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
J3QRK9 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
J3QRK9 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
J3QRK9 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
J3QRK9 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
J3QRK9 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
J3QRK9 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
J3QRK9 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
J3QRK9 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
J3QRK9 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
J3QRK9 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
J3QRK9 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
J3QRK9 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
J3QRK9 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
J3QRK9 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
J3QRK9 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
J3QRK9 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
J3QRK9 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
J3QRK9 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
J3QRK9 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
J3QRK9 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
J3QRK9 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
J3QRK9 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
J3QRK9 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
J3QRK9 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
J3QRK9 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
J3QRK9 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
J3QRK9 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
J3QRK9 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
J3QRK9 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
J3QRK9 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
J3QRK9 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
J3QRK9 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
J3QRK9 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
J3QRK9 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
J3QRK9 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
J3QRK9 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
J3QRK9 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
J3QRK9 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
J3QRK9 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
J3QRK9 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
J3QRK9 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
J3QRK9 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
J3QRK9 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
J3QRK9 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
J3QRK9 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
J3QRK9 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
J3QRK9 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
J3QRK9 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
J3QRK9 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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