Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
KNCNA6PVL3 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
KNCNA6PVL3 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
KNCNA6PVL3 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
KNCNA6PVL3 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
KNCNA6PVL3 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
KNCNA6PVL3 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
KNCNA6PVL3 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
KNCNA6PVL3 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
KNCNA6PVL3 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
KNCNA6PVL3 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
KNCNA6PVL3 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
KNCNA6PVL3 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
KNCNA6PVL3 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
KNCNA6PVL3 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
KNCNA6PVL3 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
KNCNA6PVL3 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
KNCNA6PVL3 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
KNCNA6PVL3 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
KNCNA6PVL3 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
KNCNA6PVL3 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
KNCNA6PVL3 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
KNCNA6PVL3 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
KNCNA6PVL3 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
KNCNA6PVL3 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
KNCNA6PVL3 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
KNCNA6PVL3 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
KNCNA6PVL3 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
KNCNA6PVL3 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
KNCNA6PVL3 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
KNCNA6PVL3 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
KNCNA6PVL3 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
KNCNA6PVL3 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
KNCNA6PVL3 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
KNCNA6PVL3 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
KNCNA6PVL3 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
KNCNA6PVL3 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
KNCNA6PVL3 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
KNCNA6PVL3 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
KNCNA6PVL3 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
KNCNA6PVL3 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
KNCNA6PVL3 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
KNCNA6PVL3 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
KNCNA6PVL3 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
KNCNA6PVL3 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
KNCNA6PVL3 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
KNCNA6PVL3 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
KNCNA6PVL3 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
KNCNA6PVL3 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
KNCNA6PVL3 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
KNCNA6PVL3 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
KNCNA6PVL3 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
KNCNA6PVL3 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
KNCNA6PVL3 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
KNCNA6PVL3 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC12.35□□□□□ -0.43
KNCNA6PVL3 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
KNCNA6PVL3 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
KNCNA6PVL3 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC12.35□□□□□ -0.43
KNCNA6PVL3 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
KNCNA6PVL3 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
KNCNA6PVL3 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
KNCNA6PVL3 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
KNCNA6PVL3 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
KNCNA6PVL3 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
KNCNA6PVL3 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
KNCNA6PVL3 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
KNCNA6PVL3 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
KNCNA6PVL3 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
KNCNA6PVL3 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
KNCNA6PVL3 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
KNCNA6PVL3 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
KNCNA6PVL3 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
KNCNA6PVL3 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
KNCNA6PVL3 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
KNCNA6PVL3 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
KNCNA6PVL3 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
KNCNA6PVL3 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
KNCNA6PVL3 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
KNCNA6PVL3 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
KNCNA6PVL3 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
KNCNA6PVL3 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
KNCNA6PVL3 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
KNCNA6PVL3 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
KNCNA6PVL3 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
KNCNA6PVL3 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
KNCNA6PVL3 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
KNCNA6PVL3 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
KNCNA6PVL3 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
KNCNA6PVL3 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
KNCNA6PVL3 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
KNCNA6PVL3 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
KNCNA6PVL3 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
KNCNA6PVL3 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
KNCNA6PVL3 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
KNCNA6PVL3 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
KNCNA6PVL3 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
KNCNA6PVL3 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
KNCNA6PVL3 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
KNCNA6PVL3 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
KNCNA6PVL3 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms