Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4P1

ATG4B, Cysteine protease ATG4B, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4BQ9Y4P1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG4BQ9Y4P1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATG4BQ9Y4P1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ATG4BQ9Y4P1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATG4BQ9Y4P1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATG4BQ9Y4P1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATG4BQ9Y4P1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ATG4BQ9Y4P1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATG4BQ9Y4P1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATG4BQ9Y4P1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATG4BQ9Y4P1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATG4BQ9Y4P1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATG4BQ9Y4P1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG4BQ9Y4P1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG4BQ9Y4P1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG4BQ9Y4P1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG4BQ9Y4P1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG4BQ9Y4P1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG4BQ9Y4P1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG4BQ9Y4P1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG4BQ9Y4P1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG4BQ9Y4P1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG4BQ9Y4P1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG4BQ9Y4P1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ATG4BQ9Y4P1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ATG4BQ9Y4P1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ATG4BQ9Y4P1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG4BQ9Y4P1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG4BQ9Y4P1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG4BQ9Y4P1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG4BQ9Y4P1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG4BQ9Y4P1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG4BQ9Y4P1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG4BQ9Y4P1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG4BQ9Y4P1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG4BQ9Y4P1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG4BQ9Y4P1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG4BQ9Y4P1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG4BQ9Y4P1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG4BQ9Y4P1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG4BQ9Y4P1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG4BQ9Y4P1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG4BQ9Y4P1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG4BQ9Y4P1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG4BQ9Y4P1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG4BQ9Y4P1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG4BQ9Y4P1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG4BQ9Y4P1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG4BQ9Y4P1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG4BQ9Y4P1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG4BQ9Y4P1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG4BQ9Y4P1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG4BQ9Y4P1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG4BQ9Y4P1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG4BQ9Y4P1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG4BQ9Y4P1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG4BQ9Y4P1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG4BQ9Y4P1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG4BQ9Y4P1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG4BQ9Y4P1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG4BQ9Y4P1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG4BQ9Y4P1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG4BQ9Y4P1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG4BQ9Y4P1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG4BQ9Y4P1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG4BQ9Y4P1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG4BQ9Y4P1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG4BQ9Y4P1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG4BQ9Y4P1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG4BQ9Y4P1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG4BQ9Y4P1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG4BQ9Y4P1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG4BQ9Y4P1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG4BQ9Y4P1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG4BQ9Y4P1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG4BQ9Y4P1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG4BQ9Y4P1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATG4BQ9Y4P1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATG4BQ9Y4P1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATG4BQ9Y4P1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATG4BQ9Y4P1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATG4BQ9Y4P1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATG4BQ9Y4P1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATG4BQ9Y4P1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATG4BQ9Y4P1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG4BQ9Y4P1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG4BQ9Y4P1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG4BQ9Y4P1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG4BQ9Y4P1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG4BQ9Y4P1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG4BQ9Y4P1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG4BQ9Y4P1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG4BQ9Y4P1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG4BQ9Y4P1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG4BQ9Y4P1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG4BQ9Y4P1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG4BQ9Y4P1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG4BQ9Y4P1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG4BQ9Y4P1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG4BQ9Y4P1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms