Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M2

SSUH2, Protein SSUH2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSUH2Q9Y2M2 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSUH2Q9Y2M2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSUH2Q9Y2M2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSUH2Q9Y2M2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSUH2Q9Y2M2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSUH2Q9Y2M2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSUH2Q9Y2M2 TMEM14EP-202ENST00000639378 1296 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SSUH2Q9Y2M2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSUH2Q9Y2M2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSUH2Q9Y2M2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSUH2Q9Y2M2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSUH2Q9Y2M2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSUH2Q9Y2M2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSUH2Q9Y2M2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSUH2Q9Y2M2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSUH2Q9Y2M2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSUH2Q9Y2M2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSUH2Q9Y2M2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSUH2Q9Y2M2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSUH2Q9Y2M2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSUH2Q9Y2M2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSUH2Q9Y2M2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSUH2Q9Y2M2 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SSUH2Q9Y2M2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSUH2Q9Y2M2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSUH2Q9Y2M2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSUH2Q9Y2M2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SSUH2Q9Y2M2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SSUH2Q9Y2M2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SSUH2Q9Y2M2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSUH2Q9Y2M2 AC010326.4-201ENST00000604665 891 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SSUH2Q9Y2M2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSUH2Q9Y2M2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSUH2Q9Y2M2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSUH2Q9Y2M2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSUH2Q9Y2M2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSUH2Q9Y2M2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SSUH2Q9Y2M2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSUH2Q9Y2M2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSUH2Q9Y2M2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SSUH2Q9Y2M2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SSUH2Q9Y2M2 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SSUH2Q9Y2M2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSUH2Q9Y2M2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSUH2Q9Y2M2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSUH2Q9Y2M2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SSUH2Q9Y2M2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSUH2Q9Y2M2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SSUH2Q9Y2M2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSUH2Q9Y2M2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSUH2Q9Y2M2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSUH2Q9Y2M2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSUH2Q9Y2M2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSUH2Q9Y2M2 AC026790.2-201ENST00000606282 430 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SSUH2Q9Y2M2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSUH2Q9Y2M2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSUH2Q9Y2M2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSUH2Q9Y2M2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SSUH2Q9Y2M2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSUH2Q9Y2M2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSUH2Q9Y2M2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSUH2Q9Y2M2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSUH2Q9Y2M2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSUH2Q9Y2M2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSUH2Q9Y2M2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSUH2Q9Y2M2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SSUH2Q9Y2M2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SSUH2Q9Y2M2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SSUH2Q9Y2M2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SSUH2Q9Y2M2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SSUH2Q9Y2M2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SSUH2Q9Y2M2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSUH2Q9Y2M2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSUH2Q9Y2M2 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSUH2Q9Y2M2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSUH2Q9Y2M2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSUH2Q9Y2M2 AC137695.1-201ENST00000604126 489 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SSUH2Q9Y2M2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSUH2Q9Y2M2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSUH2Q9Y2M2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSUH2Q9Y2M2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSUH2Q9Y2M2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSUH2Q9Y2M2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSUH2Q9Y2M2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSUH2Q9Y2M2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSUH2Q9Y2M2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSUH2Q9Y2M2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SSUH2Q9Y2M2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSUH2Q9Y2M2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSUH2Q9Y2M2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSUH2Q9Y2M2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSUH2Q9Y2M2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSUH2Q9Y2M2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSUH2Q9Y2M2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SSUH2Q9Y2M2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSUH2Q9Y2M2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSUH2Q9Y2M2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSUH2Q9Y2M2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSUH2Q9Y2M2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSUH2Q9Y2M2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms