Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
TRAPPC8Q9Y2L5 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
TRAPPC8Q9Y2L5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
TRAPPC8Q9Y2L5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
TRAPPC8Q9Y2L5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
TRAPPC8Q9Y2L5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
TRAPPC8Q9Y2L5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
TRAPPC8Q9Y2L5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
TRAPPC8Q9Y2L5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
TRAPPC8Q9Y2L5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC36.25■■■■□ 3.39
TRAPPC8Q9Y2L5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
TRAPPC8Q9Y2L5 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
TRAPPC8Q9Y2L5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
TRAPPC8Q9Y2L5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
TRAPPC8Q9Y2L5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
TRAPPC8Q9Y2L5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
TRAPPC8Q9Y2L5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
TRAPPC8Q9Y2L5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
TRAPPC8Q9Y2L5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
TRAPPC8Q9Y2L5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
TRAPPC8Q9Y2L5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
TRAPPC8Q9Y2L5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
TRAPPC8Q9Y2L5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
TRAPPC8Q9Y2L5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
TRAPPC8Q9Y2L5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
TRAPPC8Q9Y2L5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
TRAPPC8Q9Y2L5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
TRAPPC8Q9Y2L5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
TRAPPC8Q9Y2L5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
TRAPPC8Q9Y2L5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
TRAPPC8Q9Y2L5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
TRAPPC8Q9Y2L5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
TRAPPC8Q9Y2L5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
TRAPPC8Q9Y2L5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
TRAPPC8Q9Y2L5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
TRAPPC8Q9Y2L5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC36.18■■■■□ 3.38
TRAPPC8Q9Y2L5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC36.18■■■■□ 3.38
TRAPPC8Q9Y2L5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
TRAPPC8Q9Y2L5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
TRAPPC8Q9Y2L5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
TRAPPC8Q9Y2L5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
TRAPPC8Q9Y2L5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
TRAPPC8Q9Y2L5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
TRAPPC8Q9Y2L5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
TRAPPC8Q9Y2L5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
TRAPPC8Q9Y2L5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
TRAPPC8Q9Y2L5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
TRAPPC8Q9Y2L5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
TRAPPC8Q9Y2L5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
TRAPPC8Q9Y2L5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
TRAPPC8Q9Y2L5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
TRAPPC8Q9Y2L5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
TRAPPC8Q9Y2L5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
TRAPPC8Q9Y2L5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
TRAPPC8Q9Y2L5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
TRAPPC8Q9Y2L5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
TRAPPC8Q9Y2L5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
TRAPPC8Q9Y2L5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
TRAPPC8Q9Y2L5 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC36.13■■■■□ 3.37
TRAPPC8Q9Y2L5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC36.13■■■■□ 3.37
TRAPPC8Q9Y2L5 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC36.13■■■■□ 3.37
TRAPPC8Q9Y2L5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
TRAPPC8Q9Y2L5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
TRAPPC8Q9Y2L5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
TRAPPC8Q9Y2L5 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
TRAPPC8Q9Y2L5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
TRAPPC8Q9Y2L5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC36.12■■■■□ 3.37
TRAPPC8Q9Y2L5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
TRAPPC8Q9Y2L5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
TRAPPC8Q9Y2L5 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC36.12■■■■□ 3.37
TRAPPC8Q9Y2L5 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC36.1■■■■□ 3.37
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
TRAPPC8Q9Y2L5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
TRAPPC8Q9Y2L5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
TRAPPC8Q9Y2L5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
TRAPPC8Q9Y2L5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
TRAPPC8Q9Y2L5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
TRAPPC8Q9Y2L5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
TRAPPC8Q9Y2L5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
TRAPPC8Q9Y2L5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC36.07■■■■□ 3.36
TRAPPC8Q9Y2L5 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC36.07■■■■□ 3.36
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
TRAPPC8Q9Y2L5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
TRAPPC8Q9Y2L5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
TRAPPC8Q9Y2L5 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
TRAPPC8Q9Y2L5 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
TRAPPC8Q9Y2L5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
TRAPPC8Q9Y2L5 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms