Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP20Q9Y2K6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP20Q9Y2K6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP20Q9Y2K6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP20Q9Y2K6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP20Q9Y2K6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP20Q9Y2K6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP20Q9Y2K6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP20Q9Y2K6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP20Q9Y2K6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP20Q9Y2K6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP20Q9Y2K6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP20Q9Y2K6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP20Q9Y2K6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP20Q9Y2K6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP20Q9Y2K6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP20Q9Y2K6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
USP20Q9Y2K6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
USP20Q9Y2K6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
USP20Q9Y2K6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP20Q9Y2K6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP20Q9Y2K6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP20Q9Y2K6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP20Q9Y2K6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP20Q9Y2K6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP20Q9Y2K6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP20Q9Y2K6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP20Q9Y2K6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP20Q9Y2K6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP20Q9Y2K6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP20Q9Y2K6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP20Q9Y2K6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP20Q9Y2K6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP20Q9Y2K6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP20Q9Y2K6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
USP20Q9Y2K6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP20Q9Y2K6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP20Q9Y2K6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP20Q9Y2K6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP20Q9Y2K6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP20Q9Y2K6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
USP20Q9Y2K6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP20Q9Y2K6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP20Q9Y2K6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP20Q9Y2K6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP20Q9Y2K6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP20Q9Y2K6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP20Q9Y2K6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP20Q9Y2K6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
USP20Q9Y2K6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP20Q9Y2K6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
USP20Q9Y2K6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
USP20Q9Y2K6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP20Q9Y2K6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP20Q9Y2K6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP20Q9Y2K6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP20Q9Y2K6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP20Q9Y2K6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP20Q9Y2K6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP20Q9Y2K6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP20Q9Y2K6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP20Q9Y2K6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP20Q9Y2K6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP20Q9Y2K6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP20Q9Y2K6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP20Q9Y2K6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP20Q9Y2K6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
USP20Q9Y2K6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP20Q9Y2K6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP20Q9Y2K6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP20Q9Y2K6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP20Q9Y2K6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP20Q9Y2K6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP20Q9Y2K6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP20Q9Y2K6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP20Q9Y2K6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP20Q9Y2K6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP20Q9Y2K6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP20Q9Y2K6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP20Q9Y2K6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP20Q9Y2K6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP20Q9Y2K6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP20Q9Y2K6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP20Q9Y2K6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP20Q9Y2K6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP20Q9Y2K6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP20Q9Y2K6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP20Q9Y2K6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP20Q9Y2K6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP20Q9Y2K6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP20Q9Y2K6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP20Q9Y2K6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP20Q9Y2K6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP20Q9Y2K6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
USP20Q9Y2K6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP20Q9Y2K6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP20Q9Y2K6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP20Q9Y2K6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP20Q9Y2K6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP20Q9Y2K6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms