Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPN9

TRIM33, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM33, humanhuman

Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM33Q9UPN9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM33Q9UPN9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM33Q9UPN9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM33Q9UPN9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM33Q9UPN9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM33Q9UPN9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM33Q9UPN9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM33Q9UPN9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM33Q9UPN9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM33Q9UPN9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM33Q9UPN9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM33Q9UPN9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM33Q9UPN9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM33Q9UPN9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM33Q9UPN9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM33Q9UPN9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM33Q9UPN9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM33Q9UPN9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM33Q9UPN9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM33Q9UPN9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM33Q9UPN9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM33Q9UPN9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM33Q9UPN9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM33Q9UPN9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM33Q9UPN9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM33Q9UPN9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM33Q9UPN9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM33Q9UPN9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM33Q9UPN9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM33Q9UPN9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM33Q9UPN9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM33Q9UPN9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM33Q9UPN9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM33Q9UPN9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM33Q9UPN9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM33Q9UPN9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRIM33Q9UPN9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRIM33Q9UPN9 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRIM33Q9UPN9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
TRIM33Q9UPN9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRIM33Q9UPN9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM33Q9UPN9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM33Q9UPN9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM33Q9UPN9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM33Q9UPN9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM33Q9UPN9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM33Q9UPN9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM33Q9UPN9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM33Q9UPN9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM33Q9UPN9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM33Q9UPN9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM33Q9UPN9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM33Q9UPN9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM33Q9UPN9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM33Q9UPN9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM33Q9UPN9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM33Q9UPN9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM33Q9UPN9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM33Q9UPN9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM33Q9UPN9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM33Q9UPN9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM33Q9UPN9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM33Q9UPN9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM33Q9UPN9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM33Q9UPN9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM33Q9UPN9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM33Q9UPN9 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM33Q9UPN9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM33Q9UPN9 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM33Q9UPN9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM33Q9UPN9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM33Q9UPN9 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM33Q9UPN9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM33Q9UPN9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM33Q9UPN9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM33Q9UPN9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM33Q9UPN9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM33Q9UPN9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM33Q9UPN9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
TRIM33Q9UPN9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM33Q9UPN9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM33Q9UPN9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM33Q9UPN9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM33Q9UPN9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM33Q9UPN9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM33Q9UPN9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM33Q9UPN9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM33Q9UPN9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM33Q9UPN9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM33Q9UPN9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM33Q9UPN9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM33Q9UPN9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM33Q9UPN9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM33Q9UPN9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM33Q9UPN9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM33Q9UPN9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM33Q9UPN9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM33Q9UPN9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM33Q9UPN9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM33Q9UPN9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms