Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS6

SYNPO2, Synaptopodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPO2Q9UMS6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SYNPO2Q9UMS6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SYNPO2Q9UMS6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SYNPO2Q9UMS6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SYNPO2Q9UMS6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SYNPO2Q9UMS6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SYNPO2Q9UMS6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SYNPO2Q9UMS6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SYNPO2Q9UMS6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SYNPO2Q9UMS6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SYNPO2Q9UMS6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SYNPO2Q9UMS6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SYNPO2Q9UMS6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SYNPO2Q9UMS6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SYNPO2Q9UMS6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SYNPO2Q9UMS6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SYNPO2Q9UMS6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SYNPO2Q9UMS6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SYNPO2Q9UMS6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SYNPO2Q9UMS6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SYNPO2Q9UMS6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SYNPO2Q9UMS6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SYNPO2Q9UMS6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SYNPO2Q9UMS6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SYNPO2Q9UMS6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SYNPO2Q9UMS6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SYNPO2Q9UMS6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SYNPO2Q9UMS6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SYNPO2Q9UMS6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SYNPO2Q9UMS6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SYNPO2Q9UMS6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SYNPO2Q9UMS6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SYNPO2Q9UMS6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SYNPO2Q9UMS6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SYNPO2Q9UMS6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SYNPO2Q9UMS6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SYNPO2Q9UMS6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SYNPO2Q9UMS6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SYNPO2Q9UMS6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SYNPO2Q9UMS6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SYNPO2Q9UMS6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SYNPO2Q9UMS6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SYNPO2Q9UMS6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SYNPO2Q9UMS6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SYNPO2Q9UMS6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SYNPO2Q9UMS6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SYNPO2Q9UMS6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SYNPO2Q9UMS6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SYNPO2Q9UMS6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SYNPO2Q9UMS6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SYNPO2Q9UMS6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SYNPO2Q9UMS6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SYNPO2Q9UMS6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SYNPO2Q9UMS6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SYNPO2Q9UMS6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SYNPO2Q9UMS6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SYNPO2Q9UMS6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SYNPO2Q9UMS6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SYNPO2Q9UMS6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SYNPO2Q9UMS6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SYNPO2Q9UMS6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SYNPO2Q9UMS6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SYNPO2Q9UMS6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYNPO2Q9UMS6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYNPO2Q9UMS6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYNPO2Q9UMS6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYNPO2Q9UMS6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SYNPO2Q9UMS6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYNPO2Q9UMS6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYNPO2Q9UMS6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SYNPO2Q9UMS6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYNPO2Q9UMS6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYNPO2Q9UMS6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYNPO2Q9UMS6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYNPO2Q9UMS6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SYNPO2Q9UMS6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYNPO2Q9UMS6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYNPO2Q9UMS6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYNPO2Q9UMS6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYNPO2Q9UMS6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYNPO2Q9UMS6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SYNPO2Q9UMS6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SYNPO2Q9UMS6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SYNPO2Q9UMS6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SYNPO2Q9UMS6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SYNPO2Q9UMS6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SYNPO2Q9UMS6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SYNPO2Q9UMS6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SYNPO2Q9UMS6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SYNPO2Q9UMS6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SYNPO2Q9UMS6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SYNPO2Q9UMS6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SYNPO2Q9UMS6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SYNPO2Q9UMS6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SYNPO2Q9UMS6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SYNPO2Q9UMS6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SYNPO2Q9UMS6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SYNPO2Q9UMS6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SYNPO2Q9UMS6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
SYNPO2Q9UMS6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms