Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM00

TMCO1, Calcium load-activated calcium channel, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO1Q9UM00 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMCO1Q9UM00 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMCO1Q9UM00 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMCO1Q9UM00 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMCO1Q9UM00 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMCO1Q9UM00 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMCO1Q9UM00 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMCO1Q9UM00 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMCO1Q9UM00 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMCO1Q9UM00 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMCO1Q9UM00 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMCO1Q9UM00 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMCO1Q9UM00 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMCO1Q9UM00 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMCO1Q9UM00 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMCO1Q9UM00 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TMCO1Q9UM00 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TMCO1Q9UM00 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMCO1Q9UM00 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMCO1Q9UM00 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMCO1Q9UM00 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMCO1Q9UM00 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMCO1Q9UM00 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMCO1Q9UM00 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMCO1Q9UM00 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMCO1Q9UM00 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMCO1Q9UM00 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMCO1Q9UM00 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMCO1Q9UM00 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMCO1Q9UM00 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMCO1Q9UM00 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMCO1Q9UM00 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TMCO1Q9UM00 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMCO1Q9UM00 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
TMCO1Q9UM00 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMCO1Q9UM00 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMCO1Q9UM00 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMCO1Q9UM00 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TMCO1Q9UM00 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMCO1Q9UM00 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMCO1Q9UM00 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMCO1Q9UM00 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMCO1Q9UM00 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMCO1Q9UM00 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMCO1Q9UM00 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMCO1Q9UM00 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMCO1Q9UM00 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMCO1Q9UM00 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMCO1Q9UM00 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMCO1Q9UM00 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMCO1Q9UM00 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMCO1Q9UM00 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TMCO1Q9UM00 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMCO1Q9UM00 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMCO1Q9UM00 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMCO1Q9UM00 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMCO1Q9UM00 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMCO1Q9UM00 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMCO1Q9UM00 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMCO1Q9UM00 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMCO1Q9UM00 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMCO1Q9UM00 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMCO1Q9UM00 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMCO1Q9UM00 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMCO1Q9UM00 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMCO1Q9UM00 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMCO1Q9UM00 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMCO1Q9UM00 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TMCO1Q9UM00 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMCO1Q9UM00 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMCO1Q9UM00 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMCO1Q9UM00 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMCO1Q9UM00 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMCO1Q9UM00 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TMCO1Q9UM00 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TMCO1Q9UM00 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMCO1Q9UM00 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMCO1Q9UM00 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMCO1Q9UM00 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMCO1Q9UM00 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMCO1Q9UM00 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMCO1Q9UM00 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMCO1Q9UM00 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TMCO1Q9UM00 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMCO1Q9UM00 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMCO1Q9UM00 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMCO1Q9UM00 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMCO1Q9UM00 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMCO1Q9UM00 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMCO1Q9UM00 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMCO1Q9UM00 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMCO1Q9UM00 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMCO1Q9UM00 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMCO1Q9UM00 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMCO1Q9UM00 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMCO1Q9UM00 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMCO1Q9UM00 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMCO1Q9UM00 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMCO1Q9UM00 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMCO1Q9UM00 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 151.4 ms