Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG9

CROT, Peroxisomal carnitine O-octanoyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROTQ9UKG9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CROTQ9UKG9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CROTQ9UKG9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CROTQ9UKG9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CROTQ9UKG9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CROTQ9UKG9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CROTQ9UKG9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CROTQ9UKG9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CROTQ9UKG9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CROTQ9UKG9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CROTQ9UKG9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CROTQ9UKG9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CROTQ9UKG9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CROTQ9UKG9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CROTQ9UKG9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CROTQ9UKG9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CROTQ9UKG9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CROTQ9UKG9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CROTQ9UKG9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CROTQ9UKG9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CROTQ9UKG9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CROTQ9UKG9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CROTQ9UKG9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CROTQ9UKG9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CROTQ9UKG9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CROTQ9UKG9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CROTQ9UKG9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CROTQ9UKG9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CROTQ9UKG9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CROTQ9UKG9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CROTQ9UKG9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CROTQ9UKG9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CROTQ9UKG9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CROTQ9UKG9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CROTQ9UKG9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CROTQ9UKG9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CROTQ9UKG9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CROTQ9UKG9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CROTQ9UKG9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CROTQ9UKG9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CROTQ9UKG9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CROTQ9UKG9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CROTQ9UKG9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CROTQ9UKG9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CROTQ9UKG9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CROTQ9UKG9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CROTQ9UKG9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CROTQ9UKG9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CROTQ9UKG9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CROTQ9UKG9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CROTQ9UKG9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CROTQ9UKG9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CROTQ9UKG9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CROTQ9UKG9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CROTQ9UKG9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CROTQ9UKG9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CROTQ9UKG9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CROTQ9UKG9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CROTQ9UKG9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CROTQ9UKG9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CROTQ9UKG9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CROTQ9UKG9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CROTQ9UKG9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CROTQ9UKG9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CROTQ9UKG9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CROTQ9UKG9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CROTQ9UKG9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CROTQ9UKG9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CROTQ9UKG9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CROTQ9UKG9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CROTQ9UKG9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CROTQ9UKG9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CROTQ9UKG9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CROTQ9UKG9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CROTQ9UKG9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CROTQ9UKG9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CROTQ9UKG9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CROTQ9UKG9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CROTQ9UKG9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CROTQ9UKG9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CROTQ9UKG9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CROTQ9UKG9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CROTQ9UKG9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CROTQ9UKG9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CROTQ9UKG9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CROTQ9UKG9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CROTQ9UKG9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CROTQ9UKG9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CROTQ9UKG9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CROTQ9UKG9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CROTQ9UKG9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CROTQ9UKG9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CROTQ9UKG9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CROTQ9UKG9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CROTQ9UKG9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CROTQ9UKG9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CROTQ9UKG9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CROTQ9UKG9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CROTQ9UKG9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CROTQ9UKG9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 156.7 ms