Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPASTQ9UBP0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPASTQ9UBP0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPASTQ9UBP0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPASTQ9UBP0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPASTQ9UBP0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPASTQ9UBP0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPASTQ9UBP0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPASTQ9UBP0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPASTQ9UBP0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SPASTQ9UBP0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPASTQ9UBP0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPASTQ9UBP0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPASTQ9UBP0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPASTQ9UBP0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPASTQ9UBP0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPASTQ9UBP0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPASTQ9UBP0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SPASTQ9UBP0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPASTQ9UBP0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPASTQ9UBP0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPASTQ9UBP0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPASTQ9UBP0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPASTQ9UBP0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPASTQ9UBP0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPASTQ9UBP0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPASTQ9UBP0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPASTQ9UBP0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPASTQ9UBP0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPASTQ9UBP0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPASTQ9UBP0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPASTQ9UBP0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPASTQ9UBP0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPASTQ9UBP0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPASTQ9UBP0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPASTQ9UBP0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPASTQ9UBP0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPASTQ9UBP0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPASTQ9UBP0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPASTQ9UBP0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPASTQ9UBP0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPASTQ9UBP0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPASTQ9UBP0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPASTQ9UBP0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPASTQ9UBP0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPASTQ9UBP0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPASTQ9UBP0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPASTQ9UBP0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPASTQ9UBP0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SPASTQ9UBP0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPASTQ9UBP0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPASTQ9UBP0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SPASTQ9UBP0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPASTQ9UBP0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPASTQ9UBP0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPASTQ9UBP0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPASTQ9UBP0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPASTQ9UBP0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPASTQ9UBP0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPASTQ9UBP0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPASTQ9UBP0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPASTQ9UBP0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPASTQ9UBP0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPASTQ9UBP0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPASTQ9UBP0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPASTQ9UBP0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPASTQ9UBP0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPASTQ9UBP0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPASTQ9UBP0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SPASTQ9UBP0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SPASTQ9UBP0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPASTQ9UBP0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPASTQ9UBP0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SPASTQ9UBP0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPASTQ9UBP0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPASTQ9UBP0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPASTQ9UBP0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SPASTQ9UBP0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPASTQ9UBP0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPASTQ9UBP0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPASTQ9UBP0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPASTQ9UBP0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPASTQ9UBP0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SPASTQ9UBP0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPASTQ9UBP0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPASTQ9UBP0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPASTQ9UBP0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPASTQ9UBP0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPASTQ9UBP0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPASTQ9UBP0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPASTQ9UBP0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPASTQ9UBP0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPASTQ9UBP0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPASTQ9UBP0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPASTQ9UBP0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPASTQ9UBP0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPASTQ9UBP0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPASTQ9UBP0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPASTQ9UBP0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPASTQ9UBP0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms