Protein–RNA interactions for Protein: Q9P298

HIGD1B, HIG1 domain family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1BQ9P298 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HIGD1BQ9P298 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HIGD1BQ9P298 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIGD1BQ9P298 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIGD1BQ9P298 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIGD1BQ9P298 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIGD1BQ9P298 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIGD1BQ9P298 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIGD1BQ9P298 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIGD1BQ9P298 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIGD1BQ9P298 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIGD1BQ9P298 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIGD1BQ9P298 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HIGD1BQ9P298 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HIGD1BQ9P298 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HIGD1BQ9P298 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HIGD1BQ9P298 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HIGD1BQ9P298 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HIGD1BQ9P298 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIGD1BQ9P298 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIGD1BQ9P298 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIGD1BQ9P298 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIGD1BQ9P298 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIGD1BQ9P298 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIGD1BQ9P298 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIGD1BQ9P298 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIGD1BQ9P298 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIGD1BQ9P298 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIGD1BQ9P298 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIGD1BQ9P298 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIGD1BQ9P298 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIGD1BQ9P298 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIGD1BQ9P298 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIGD1BQ9P298 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIGD1BQ9P298 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIGD1BQ9P298 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIGD1BQ9P298 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
HIGD1BQ9P298 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIGD1BQ9P298 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIGD1BQ9P298 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIGD1BQ9P298 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIGD1BQ9P298 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIGD1BQ9P298 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIGD1BQ9P298 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIGD1BQ9P298 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIGD1BQ9P298 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIGD1BQ9P298 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIGD1BQ9P298 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIGD1BQ9P298 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIGD1BQ9P298 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIGD1BQ9P298 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIGD1BQ9P298 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIGD1BQ9P298 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIGD1BQ9P298 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIGD1BQ9P298 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIGD1BQ9P298 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIGD1BQ9P298 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIGD1BQ9P298 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIGD1BQ9P298 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIGD1BQ9P298 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIGD1BQ9P298 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIGD1BQ9P298 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIGD1BQ9P298 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIGD1BQ9P298 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIGD1BQ9P298 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIGD1BQ9P298 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIGD1BQ9P298 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIGD1BQ9P298 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIGD1BQ9P298 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIGD1BQ9P298 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIGD1BQ9P298 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIGD1BQ9P298 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIGD1BQ9P298 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIGD1BQ9P298 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIGD1BQ9P298 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIGD1BQ9P298 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIGD1BQ9P298 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIGD1BQ9P298 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIGD1BQ9P298 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIGD1BQ9P298 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIGD1BQ9P298 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIGD1BQ9P298 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HIGD1BQ9P298 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIGD1BQ9P298 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIGD1BQ9P298 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIGD1BQ9P298 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIGD1BQ9P298 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIGD1BQ9P298 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HIGD1BQ9P298 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIGD1BQ9P298 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIGD1BQ9P298 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIGD1BQ9P298 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIGD1BQ9P298 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIGD1BQ9P298 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIGD1BQ9P298 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HIGD1BQ9P298 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIGD1BQ9P298 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIGD1BQ9P298 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HIGD1BQ9P298 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HIGD1BQ9P298 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms