Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZM6

PKD2L2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2L2Q9NZM6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PKD2L2Q9NZM6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PKD2L2Q9NZM6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PKD2L2Q9NZM6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PKD2L2Q9NZM6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PKD2L2Q9NZM6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PKD2L2Q9NZM6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PKD2L2Q9NZM6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PKD2L2Q9NZM6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PKD2L2Q9NZM6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PKD2L2Q9NZM6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PKD2L2Q9NZM6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PKD2L2Q9NZM6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PKD2L2Q9NZM6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PKD2L2Q9NZM6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PKD2L2Q9NZM6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PKD2L2Q9NZM6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PKD2L2Q9NZM6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PKD2L2Q9NZM6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PKD2L2Q9NZM6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PKD2L2Q9NZM6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PKD2L2Q9NZM6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PKD2L2Q9NZM6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PKD2L2Q9NZM6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PKD2L2Q9NZM6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PKD2L2Q9NZM6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PKD2L2Q9NZM6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PKD2L2Q9NZM6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PKD2L2Q9NZM6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PKD2L2Q9NZM6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PKD2L2Q9NZM6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PKD2L2Q9NZM6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PKD2L2Q9NZM6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PKD2L2Q9NZM6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PKD2L2Q9NZM6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PKD2L2Q9NZM6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PKD2L2Q9NZM6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PKD2L2Q9NZM6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PKD2L2Q9NZM6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PKD2L2Q9NZM6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PKD2L2Q9NZM6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PKD2L2Q9NZM6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PKD2L2Q9NZM6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PKD2L2Q9NZM6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PKD2L2Q9NZM6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PKD2L2Q9NZM6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PKD2L2Q9NZM6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PKD2L2Q9NZM6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PKD2L2Q9NZM6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PKD2L2Q9NZM6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PKD2L2Q9NZM6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PKD2L2Q9NZM6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PKD2L2Q9NZM6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PKD2L2Q9NZM6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PKD2L2Q9NZM6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PKD2L2Q9NZM6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PKD2L2Q9NZM6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PKD2L2Q9NZM6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PKD2L2Q9NZM6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PKD2L2Q9NZM6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PKD2L2Q9NZM6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PKD2L2Q9NZM6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PKD2L2Q9NZM6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PKD2L2Q9NZM6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PKD2L2Q9NZM6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PKD2L2Q9NZM6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PKD2L2Q9NZM6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PKD2L2Q9NZM6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PKD2L2Q9NZM6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PKD2L2Q9NZM6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PKD2L2Q9NZM6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PKD2L2Q9NZM6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PKD2L2Q9NZM6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PKD2L2Q9NZM6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PKD2L2Q9NZM6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PKD2L2Q9NZM6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PKD2L2Q9NZM6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PKD2L2Q9NZM6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PKD2L2Q9NZM6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PKD2L2Q9NZM6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PKD2L2Q9NZM6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PKD2L2Q9NZM6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PKD2L2Q9NZM6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PKD2L2Q9NZM6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PKD2L2Q9NZM6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PKD2L2Q9NZM6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PKD2L2Q9NZM6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PKD2L2Q9NZM6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PKD2L2Q9NZM6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKD2L2Q9NZM6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKD2L2Q9NZM6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKD2L2Q9NZM6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKD2L2Q9NZM6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKD2L2Q9NZM6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKD2L2Q9NZM6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKD2L2Q9NZM6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PKD2L2Q9NZM6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PKD2L2Q9NZM6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PKD2L2Q9NZM6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PKD2L2Q9NZM6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms