Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX70

MED29, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 29, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED29Q9NX70 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MED29Q9NX70 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MED29Q9NX70 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
MED29Q9NX70 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MED29Q9NX70 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MED29Q9NX70 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MED29Q9NX70 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MED29Q9NX70 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MED29Q9NX70 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MED29Q9NX70 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MED29Q9NX70 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MED29Q9NX70 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MED29Q9NX70 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MED29Q9NX70 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MED29Q9NX70 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MED29Q9NX70 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MED29Q9NX70 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MED29Q9NX70 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MED29Q9NX70 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MED29Q9NX70 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MED29Q9NX70 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MED29Q9NX70 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MED29Q9NX70 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MED29Q9NX70 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
MED29Q9NX70 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
MED29Q9NX70 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MED29Q9NX70 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MED29Q9NX70 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
MED29Q9NX70 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
MED29Q9NX70 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MED29Q9NX70 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MED29Q9NX70 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MED29Q9NX70 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MED29Q9NX70 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MED29Q9NX70 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MED29Q9NX70 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
MED29Q9NX70 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MED29Q9NX70 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MED29Q9NX70 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MED29Q9NX70 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MED29Q9NX70 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MED29Q9NX70 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MED29Q9NX70 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MED29Q9NX70 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MED29Q9NX70 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
MED29Q9NX70 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MED29Q9NX70 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MED29Q9NX70 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
MED29Q9NX70 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MED29Q9NX70 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MED29Q9NX70 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MED29Q9NX70 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
MED29Q9NX70 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
MED29Q9NX70 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MED29Q9NX70 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
MED29Q9NX70 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MED29Q9NX70 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
MED29Q9NX70 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MED29Q9NX70 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MED29Q9NX70 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
MED29Q9NX70 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MED29Q9NX70 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MED29Q9NX70 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
MED29Q9NX70 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MED29Q9NX70 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MED29Q9NX70 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MED29Q9NX70 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MED29Q9NX70 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MED29Q9NX70 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MED29Q9NX70 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
MED29Q9NX70 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MED29Q9NX70 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MED29Q9NX70 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MED29Q9NX70 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MED29Q9NX70 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MED29Q9NX70 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MED29Q9NX70 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MED29Q9NX70 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MED29Q9NX70 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MED29Q9NX70 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MED29Q9NX70 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MED29Q9NX70 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MED29Q9NX70 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MED29Q9NX70 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MED29Q9NX70 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MED29Q9NX70 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MED29Q9NX70 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MED29Q9NX70 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MED29Q9NX70 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MED29Q9NX70 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MED29Q9NX70 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MED29Q9NX70 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MED29Q9NX70 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MED29Q9NX70 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MED29Q9NX70 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MED29Q9NX70 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MED29Q9NX70 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
MED29Q9NX70 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MED29Q9NX70 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MED29Q9NX70 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms