Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVH1

DNAJC11, DnaJ homolog subfamily C member 11, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC11Q9NVH1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNAJC11Q9NVH1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNAJC11Q9NVH1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNAJC11Q9NVH1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNAJC11Q9NVH1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNAJC11Q9NVH1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNAJC11Q9NVH1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNAJC11Q9NVH1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNAJC11Q9NVH1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNAJC11Q9NVH1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNAJC11Q9NVH1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
DNAJC11Q9NVH1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DNAJC11Q9NVH1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DNAJC11Q9NVH1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DNAJC11Q9NVH1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DNAJC11Q9NVH1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DNAJC11Q9NVH1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DNAJC11Q9NVH1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DNAJC11Q9NVH1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23■■□□□ 1.27
DNAJC11Q9NVH1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DNAJC11Q9NVH1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNAJC11Q9NVH1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNAJC11Q9NVH1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNAJC11Q9NVH1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNAJC11Q9NVH1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNAJC11Q9NVH1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNAJC11Q9NVH1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNAJC11Q9NVH1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNAJC11Q9NVH1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNAJC11Q9NVH1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNAJC11Q9NVH1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNAJC11Q9NVH1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNAJC11Q9NVH1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNAJC11Q9NVH1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNAJC11Q9NVH1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
DNAJC11Q9NVH1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNAJC11Q9NVH1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNAJC11Q9NVH1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNAJC11Q9NVH1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNAJC11Q9NVH1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNAJC11Q9NVH1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNAJC11Q9NVH1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNAJC11Q9NVH1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNAJC11Q9NVH1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNAJC11Q9NVH1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNAJC11Q9NVH1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNAJC11Q9NVH1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNAJC11Q9NVH1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNAJC11Q9NVH1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNAJC11Q9NVH1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNAJC11Q9NVH1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNAJC11Q9NVH1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNAJC11Q9NVH1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNAJC11Q9NVH1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNAJC11Q9NVH1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNAJC11Q9NVH1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DNAJC11Q9NVH1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DNAJC11Q9NVH1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DNAJC11Q9NVH1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
DNAJC11Q9NVH1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
DNAJC11Q9NVH1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DNAJC11Q9NVH1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DNAJC11Q9NVH1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DNAJC11Q9NVH1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DNAJC11Q9NVH1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DNAJC11Q9NVH1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DNAJC11Q9NVH1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DNAJC11Q9NVH1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DNAJC11Q9NVH1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DNAJC11Q9NVH1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DNAJC11Q9NVH1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DNAJC11Q9NVH1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
DNAJC11Q9NVH1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
DNAJC11Q9NVH1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DNAJC11Q9NVH1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DNAJC11Q9NVH1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNAJC11Q9NVH1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNAJC11Q9NVH1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNAJC11Q9NVH1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNAJC11Q9NVH1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNAJC11Q9NVH1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNAJC11Q9NVH1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNAJC11Q9NVH1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNAJC11Q9NVH1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
DNAJC11Q9NVH1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DNAJC11Q9NVH1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DNAJC11Q9NVH1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DNAJC11Q9NVH1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DNAJC11Q9NVH1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DNAJC11Q9NVH1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DNAJC11Q9NVH1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DNAJC11Q9NVH1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DNAJC11Q9NVH1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DNAJC11Q9NVH1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNAJC11Q9NVH1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNAJC11Q9NVH1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNAJC11Q9NVH1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNAJC11Q9NVH1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
DNAJC11Q9NVH1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
DNAJC11Q9NVH1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms